Komisjoni eesmärk on tagada koostöös Riigikontrolliga kontroll Vabariigi Valitsuse üle riigieelarve täitmise ning riigi vara ja riigieelarve vahendite säästliku, tõhusa, mõjusa ja õiguspärase kasutamise osas.

Komisjoni ülesanne on:

• vaadata läbi riigi majandusaasta koondaruanne ja selle kontrolliaruanne; 
• vaadata läbi avaliku sektori auditeerimise küsimusi; 
• arutada Riigikontrolli kontrolliaruandeid ja ülevaateid ning riigikontrolöri tõstatatud olulisi küsimusi; 
• teavitada Riigikontrolli probleemidest, mis jõuavad komisjoni liikmeteni suhtlemisel ameti- ja eraisikutega; 
• võtta seisukoht Riigikontrolli informatsiooni alusel tema tegevuse takistamise juhtude kohta.

Vähemalt kord aastas annab komisjon oma tegevusest aru Riigikogule.

XII Riigikogu moodustas riigieelarve kontrolli erikomisjoni oma 5. mai 2011. a otsusega.

Komisjoni istungid on avalikud. Istungi või selle osa võib komisjoni otsusega kuulutada kinniseks, et kaitsta isikuandmeid, panga-, äri- või riigisaladust.